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   日期:2023-04-15     浏览:39    评论:0    
核心提示:生命科学科研工作者应该学会使用哪些软件文献管理与分析:EndNote X1,文献管理软件,平时方便论文管理,写文章的时候插入文献也是相当的方便;RefViz 2.1,文献分析软件,与EndNote结合

生命科学科研工作者应该学会使用哪些软件

文献管理与分析:

EndNote X1,文献管理软件,平时方便论文管理,写文章的时候插入文献也是相当的方便;

RefViz 2.1,文献分析软件,与EndNote结合使用,分析文献,可以省掉大把自己看自己归纳的时间;

ReferenceManager似乎很久没有更新了,Thomoson看来以后可能只管EndNote了。

2.分子生物学综合软件:

Vector NTI 10.3,分子生物学的综合软件,什么功能几乎都全了;

BioEdit 7,杂七杂八的功能凑在一起的一个分子生物学软件,有些罕见的Vector NTI所没有的功能;

DNAMAN 6,与Vector NTI类似的一个软件,但是图型化上做的很差,集成度和序列的管理功能比Vector NTI差的不是一点点,罕用,但有时候有些序列的格式非得要用它的样子排,没有办法;

3. 大分子二维/三维结构绘图软件:

PyMol 0.99,有1.0,可惜要钱了,也没有P-J。蛋白质三维结构查看软件,神奇的就在于它可以编辑小范围内的结构;

DeepViewer 3.7,PDB Viewer的换汤不换药升级版,在预测功能上有所突破,期待新版本的出现令其可与PyMol有的一拼,谁叫PyMol在Windows下开始收钱呢?为了一个PyMol装个Linux似乎还没有这样大的动力;

RNADraw 1.1,RNA和DNA二级结构的分析软件,可以分析做PCR的时候的引物的二聚体,更直观一些;

Accelery Insight II,Linux下的大型三维结构模拟软件,2.1 G!据称是非常强大。为了这个装个Linux似乎还说的过去。

4. 质粒绘图软件:

Vector NTI和DNAMAN其实也可以画,但是不如下面这几个来的专业或方便:

SimVector 4,与Primer Premier同一家公司的软件,画质粒的一个软件,效果还行,与VectorNTI画出来的风格不一样,有的杂志喜欢;

WinPlas 2.7,很老的质粒绘图软件,很久没有升级了,画出来的质量非常差,可是小,比较快;

Visual Cloning 3.2.4,一个界面豪华的质粒及克隆整个过程的画图软件,大而慢,选用。

5. 引物设计软件:

Primer premier 5,引物设计软件,大家都用,我也用;

Oligo 6.7包1,引物设计软件,大家都用,我还用,设计Fusion PCR和In-Fusion连接的引物的时候,比Primer premier直观一些;

Allele ID 6.0/Beacon Designer 7.0,RT-PCR设计软件,与Primer Premier同一家公司的软件,软件界面非常相似,到现在也没有搞清楚两个有什么区别,不知道有什么意思,具体还需要试一下;

6. 办公软件:

Microsoft WORD 2003,不说了;

Microsoft Excel 2003,不说了;

Microsoft PowerPoint 2003,不说了;

Adobe Acrobat Professional 8.1,不说了;

PDF2Office 2.0,把PDF转成WORD,中文支持大大的好,但页面格局往往破坏的一塌糊涂;

Adult PDF Password Recovery 2.3,看名字就知道干什么的了,相当强大,加密的PDF往往不能取词不能打印;

SolidPDFConverter 3.0,把PDF转成WORD,中文支持大大的不好;

7. 凝胶分析软件:

QuantityOne 4.6.2,BioRad的凝胶成像仪自带的电泳图像软件,算很好上手的了;

GelPro Analyzer 4.5,跑胶和杂交以及菌落的分析软件,已有6.0版,可惜我这里没有破解版;

PDQuest 8.0.1 Advance,BioRad的二维电泳分析软件,算好用的,功能上没用过其它的,真的不好说;

代谢网络和信号传导分析软件:

CellNetAnalyzer 6.0,以前叫FluxAnalyzer,基于MatLab的代谢网络和信号传导网络分析模块,大部分论文中的代谢网络分析都是或明或暗的用这个分析的;

Pathw***Studio 5.0,蛋白质相互作用、细胞信号转导和代谢分析的软件;

8. 图片处理:

图片是用来表达思想最有力的工具了,所以在这里就多了一些。

Adobe Photoshop CS3 Extended,修改图片,可以做出以假乱真的效果,功能非常强大,但在画示意图上不是很方便,对线条和几何图形的支持尤为不便;

Adobe Streamline 4,好久没有升级的一个软件,把位图转成矢量图的一个软件,很好用;

Image-Pro Plus 6.0,对图象进行加工处理并得到数据的软件,专业,相当的专业,已有6.2版,可惜我这里没有破解版;

Adobe Fireworks CS3/Illustrator CS3,矢量图和位图工具二合一,可以画一些复杂的图,像GENE,MCB上面的很多图都可以很轻松的用Fireworks/Illustrator画出来,流程图,细胞结构,各种复杂的示意图等等都没有问题,矢量工具非常好用。Fireworks更适合入门。Illustrator是纯粹的矢量软件,新手用起来可能会有点不适应,特别是从Photoshop转过来的新手;

ChemSketch 10,画分子结构式的,几乎可以胜任所有的化学结构式的任务了;

SnagIt 8.5,抓图软件,同类软件里面***用的一个了,连续截屏和延迟截屏是***特色;

9. 流程图软件:

Microsoft Visio 2003,画流程图和一些复杂的示意图,与SmartDraw类似,但是在PPT里面的显示效果远胜SmartDraw,因为与PPT是一家的,兼容性更好,更方便;

SmartDraw 7.7,画流程图和一些复杂的示意图;

ConceptDraw 7.5 Professional,SmartDraw在接下来一段时间内的强有力的竞争对手,虽然SmartDraw 8 Professional进行了升级,但是却不再支持中文,相当让人失望,ConceptDraw这时候具有了天然的竞争优势了;

10. 数学统计软件:

OriginPro 8.0 SP1,画各种各样的曲线图,兼做简单的数据处理;

SigmaPlot 10.0,与Origin类似,画出来的图风格不大一样,OriginPro 8.0推出之后,SigmaPlot已经渐显颓势,期待新版本了;

SigmaStat 3.5,分析为主的一个小统计软件,在SigmaPlot中可以调用它,如果不用SigmaPlot,个人感觉其没有任何意义;

SPSS 16,大型的分析软件,几乎拥有所有的统计分析功能;

MatLab 7.1,呵呵,这样说吧,数学里面的,几乎什么都可以;

SAS JMP 7.0,SAS公司为了解决SAS难用而开发的一个软件,据一位专业级的统计分析人物推荐,觉得SPSS太不中用,还是SAS家的东西可靠些。

另外还有很多常见的分析软件如SAS 9.1,Statistica 7.0, SysStat 12.0等等,功能上都差不多,都很强大,但我们还是实验为主,能完成任务即可,实际上学精任何一个都足够用了。

其它:

UltraEdit 13.10a,取代记事本的一个强大软件,很多时候会用到,比如把CNKI的数据导到EndNote,有些软件的16进制下的P-J;

这些软件目前而言,应该可以对付从科研到发文章的所有的事情了。

minitab19保存多张图片

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Minitab 的“协助”将引导您完成整个分析,甚至可帮助您解释和显示结果。

选择合适的工具。

遍历交互式决策树以选择正确的统计工具。

正确地分析数据。

按照清晰的指南确保分析有效。使用简化的对话框快速获得结果。

自信地执行操作。

通过易于理解和导出的详细报告轻松解释您的发现。

选择合适的统计工具。

“协助”概述了选择正确分析的过程。

分步指导

交互式决策树通过提出一系列需要您回答的问题(例如,您正在处理的数据类型、您分析的目标)引导您使用正确的统计工具。

支持

在遇到无法回答的问题时,“协助”将提供正确回答问题所需的信息,例如,重要术语的定义、帮助您理解如何将问题与自己的数据关联的图解示例。

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9章:自定义 Minitab

目标

• 更改图形的默认选项

• 创建自定义工具栏

• 向自定义工具栏中添加命令

• 为菜单命令 快捷键

• 还原 Minitab 的默认选项

概述

Minitab 有若干个工具可以用于更改默认选项或创建自定义工具栏和键盘快捷方式。

使用工具 选项可更改许多 Minitab 功能的默认选项,如下所示:

• 程序设置(如,内存使用情况、初始目录、窗口布局和对话框)

• 工作表和会话窗口

• 统计命令

• 图形

使用工具 自定义可执行以下操作:

• 为菜单项 快捷键。

• 设置 Minitab 显示工具栏的方式的选项。

• 为菜单项或工具栏按钮创建自定义图标。

您已完成您的 个分析并生成了一份报表。您现在决定要使用工具 选项和工具 自定义来自定义 Minitab 界面以便方便快捷地进行将来的分析。

设置选项

在 Minitab 会话期间,您可以更改许多选项,如更改图形显示选项或启用会话命令提示符。但是,在您关闭 Minitab 时,这些选项将还原为默认设置。

如果您要将某个选项设置为所有 Minitab 会话的默认选项,请使用工具 选项。所更改选项将一直保持有效,直到再次更改这些选项为止。

注意

您可以随时恢复 Minitab 的默认选项。有关详细信息,请参阅下面的“还原 Minitab 的默认选项”。

添加自动脚注

由于未来要用类似的数据创建相同的图形,因此需要用一种方法来区分每次分析的结果。您决定向图形中添加自动脚注,以包括工作表名称和修改日期。

1. 打开样本数据出货数据.MTW。

2. 选择工具 选项。展开制图,展开注解,然后选择我的脚注。

3. 在要包括在我的脚注中的信息下,选择工作表名称和注明图形后修改的日期。

4. 在自定义文本中,输入出货中心效率。

4. 将以下数据添加到 C2 中,从 201 行开始:

3.60 2.40 2.80 3.21 2.40 2.75 2.79 3.40 2.58 2.50

在输入数据时,按 Enter 向下移动到下一单元格。如果数据输入方向箭头指向右侧,请单击该箭头使其指向下。

5. 验证输入的数据是否正确。

更新控制图

1. 右键单击 Xbar-S 控制图,然后选择立即更新图形。

显示新子组的已更新 Xbar-S 控制图

Xbar-S 控制图现在包括新子组。均值 ( = 2.926) 和标准差 ( = 0.607) 略有变化,但过程似乎仍受控。

注意

要自动更新所有图形和控制图,请选择工具 选项。展开制图,然后选择其他制图选项。选择创建时,设置当数据更改时图形自动更新。

将 x 轴标签更改为日期

默认情况下,Xbar-S 控制图上的子组按连续数字顺序加上标签。您可以改为编辑 x 轴以显示日期。

1. 双击 Xbar 控制图( 部控制图)上的 x 轴。

2. 在时间尺度选项卡的时间下,选择标记。在标记列(1-3,首先为内层)中,输入日期。

3.单击确定。

4.对 S 控制图上的 x 轴重复上述步骤。

具有已编辑 x 轴的 Xbar-S 控制图

解释结果

现在,每个控制图的 x 轴都显示日期,而不是子组数。

评估过程能力

在您确定某个过程受统计控制之后,您要知道该过程是否有能力。某个过程符合规范并产生良好部件或结果,则说明该过程有能力。您可以通过将过程变异的范围与规格限制的宽度相比较来评估过程能力。

重要信息

请勿评估不在控制范围内的能力,因为这种过程能力的估计可能不正确。

能力指数(即统计量)是评估过程能力的简单方法。由于能力指数将过程信息减少到单个数字,因此过程与过程的比较很简单。

执行能力分析

由于了解到交货过程是受控的,因此执行能力分析以确定交货过程是否在规格限之内,是否产生可接受的交货时间。规格上限 (USL) 为 6 天,因为西部交付中心经理认为订单超过 6 天后交付即为订单逾期。经理未确定规格下限 (LSL)。分布近似于正态,因此可以使用正态能力分析。

1. 选择统计 质量工具 能力分析 正态。

2. 在数据排列为下,选择单列。输入天数。

3. 在子组大小中,输入日期。

4. 在规格上限中,输入 6。

5. 单击确定。

交货过程的能力分析

解释结果

Cpk 是潜在过程能力的度量。Ppk 是总体过程能力的度量。Cpk 和 Ppk 都大于 1.33(此值通常是可接受的小值)。这些统计数据表明,西部出货中心的过程具有对应的能力,并且此出货中心可在可接受的时间范围内交付订单。

保存项目

将所有工作保存在 Minitab 项目中。

1. 选择文件 将项目另存为。

2. 浏览至要用于保存您的文件的文件夹。

3. 在文件名中,输入 MyQuality。

4. 单击保存。

在下一章中

质量分析表明,西部出货中心的过程受控,且能够符合规格限要求。在下一章中,将设计试验并分析结果,以研究进一步改进西部出货中心的交货过程的方法。

转到设计实验.

5章:设计实验

目标

• 了解 Minitab 中已设计的试验

• 创建因子设计

• 查看设计并在工作表中输入数据

• 分析设计并解释结果

• 使用存储的模型创建因子图并预测响应

概述

DOE(试验设计)可帮助您调查同一时间输入变量(因子)对输出变量(响应)的效应。这些试验由一系列运行或检验组成,在这些运行或检验中,会对输入变量进行一些有目的的更改。每次运行都会收集数据。您可以使用 DOE 来确定影响质量的过程条件和产品组件,然后确定可优化结果的因子设置。

Minitab 提供了五种类型的设计:筛选设计、因子设计、响应曲面设计、混料设计和田口设计(也称为田口强健性设计)。您在 Minitab 中执行的用于创建、分析和可视化设计的试验的步骤与所有类型的步骤类似。在执行试验并输入结果后,Minitab 会提供几种分析工具和绘图工具,以帮助您了解结果。本章介绍了用于创建和分析因子设计的典型步骤。您可以对在 Minitab 中创建的任意设计应用这些步骤。

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标签: 软件 过程 选项
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